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郑云

作者: 时间:2020-04-22

郑云 博士

教授,硕士生导师

一、工作学习经历

1994 - 1998 北京航空航天大学机械制造工程专业,工学学士

2002 -2002 新加坡基因组研究所,研究学习

2002 - 2005 新加坡南洋理工大学,博士

2005 - 2006 新加坡国立大学,研究员

2006 - 2009 美国华盛顿大学,博士后研究助理

2009 - 2013 复旦大学,副教授

2011.03- 04 美国俄克拉荷马州立大学,访问学者

2011.07- 08 新加坡南洋理工大学,访问教授

2013.04- 05 美国俄克拉荷马州立大学,访问学者

2013.11- 12 新加坡南洋理工大学,访问教授

2015.01- 02 澳大利亚悉尼科技大学,访问教授

2018.08- 09 美国华盛顿州立大学,俄克拉荷马州立大学,访问学者

2013 - 2019 昆明理工大学,副教授,PI

2014 - PLOS ONE,学术编辑

2017 - Frontiers in Genetics,学术编委

2018 第29届国际基因组信息学会议主席

2019 - 昆明理工大学,教授,PI

二、 研究领域

MicroRNA是一类最近发现的具有调控功能的重要非编码小RNA。我们目前的一些科研包括小RNA高通量测序数据分析,基于高通量测序的转录组分析,识别和鉴定microRNA在植物发育、抗逆和肝癌、结肠癌等疾病中的功能,癌症诊断新分子标记物的预测和验证,CHIP-seq数据分析,基因调控网络分析,SNP和疾病的分析,基因GO和信号通路分析,蛋白质互作网络分析。

三、 开设的课程

《计算生物学概论》、《生物信息学》

四、 代表性论文

1. Lifeng Xiang*, Yu Yin*, Yun Zheng*, Yanping Ma*, Yonggang Li*, Zhigang Zhao, Junqiang Guo, Zongyong Ai, Yuyu Niu, Kui Duan, Jingjing He, Shuchao Ren, Dan Wu, Yun Bai, Weizhi Ji#, Tianqing Li#. 2020. A developmental landscape of 3D-cultured human pre-gastrulation embryos.Nature, 577:537–542.

2. Qingyi Wang*, Zhigang Zhao*, Xiaotuo Zhang, Chenyu Lu, Shuchao Ren, Shipeng Li, Junqiang Guo, Peiran Liao, Bingbing Jiang, Yun Zheng#. 2019. Identifying MicroRNAs and Their Editing Sites in Macaca Mulatta.Cells, 8(7)

3. Xiaotuo Zhang*, Yong Zhang*, Taiyun Wang, Ziwei Li, Jinping Cheng, Haoran Ge, Qi Tang, Kun Chen, Li Liu, Chenyu Lu, Junqiang Guo, Binglian Zheng# and Yun Zheng#. 2019. A comprehensive map of intron branchpoints and lariat RNAs in plants.The Plant Cell, 31(5):956-973

4. Yun Zheng#, Li Liu, and Girish C. Shukla. 2017. A comprehensive review of web-based non-coding RNA resources for cancer research.Cancer Letters, 407:1-8

5. Yun Zheng#, Bo Ji, Renhua Song, Shengpeng Wang, Ting Li, Xiaotuo Zhang, Kun Chen, Tianqing Li, and Jinyan Li#. 2016. Accurate detection for a wide range of mutation and editing sites of microRNAs from small RNA high-throughput sequencing profiles.Nucleic Acids Research, 44(14): e123.

五、 主持项目

2010年-2012年上海市自然科学基金,项目编号10ZR1403000,主持人,10万元人民币

2009年-2012年复旦大学引进人才启动基金,主持人,45万元人民币

2013年- 昆明理工大学高端引进人才启动基金,主持人,150万元人民币

2015年-2018年国家自然科学基金,项目名称“基于生物信息学的植物中分段生成的小干扰RNA的识别、功能和进化研究”,

项目编号31460295,主持人,50万元人民币

2016年-2018年复旦大学遗传工程重点实验室开发课题,项目编号SKLGE-1511,主持人,6万元人民币

2018年-2021年国家自然科学基金,项目名称“通过集成分析小RNA和基因组高通量测序数据识别人类和灵长类疾病模型

microRNA的编辑和突变”,项目编号31760314,主持人,直接经费39万元人民币

2018年-2021年复旦大学遗传工程重点实验室开发课题,项目编号SKLGE-18141,主持人,8万元人民币

2018年-2021年国家重点研发计划,项目编号2018YFA0108502,研究骨干,承担金额100万元人民币

六、 荣誉、奖励及参加学术团体的情况

2017年09月 第16届国际生物信息学会议BMCGenomics最佳论文奖

2013年11月 新加坡南洋理工大学Visiting Professorship

2013年04月 俄克拉荷马州立大学Visiting Scholarship

2011年10月 海南省杰出自然科学论文一等奖

2011年07月-08月 新加坡南洋理工大学Visiting Professorship

2011年03月-04月 俄克拉荷马州立大学Visiting Scholarship

2006年08月-2009年01月华盛顿大学圣路易斯Postdoctoral Fellowship

2005年12月-2006年08月 新加坡国立大学Postdoctoral Fellowship

2002年09月-2005年09月 新加坡南洋理工大学Fellowship

五、 联系方式

地址:昆明市呈贡区昆明理工大学灵长类转化医学研究院(650500)

电话: 0871-65918047 86-13908869783

E-mail:zhengyun5488@gmail.com

Websites:https://publons.com/researcher/2698852/yun-zheng/

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